化粪池的清洁周期与温度，温度，建筑特性，排水水质和粪便的水量有关。如果设计清理周期过短，则化粪池粪便浓度过高，实际澄清周期之间的差距过大，影响了正常的发酵和污水处理效果，甚至造成粪便溢出和溢出。影响环境卫生。如果设计清理周期过长，化粪池的容积将太大，成本将会增加。 《建筑给水排水设计规范》(GBJ15-88)(以下称为《规范》)需要3到12个月的清理周期。实际设计需要3到9个月，而酸性发酵阶段的酸性发酵时间为3个月。酸度降低期约为5个月。实践证明，清理周期应考虑污水处理效果，建设成本和管理三个方面。
第一池和第二池的容积不同，对寄生虫卵沉淀的效果有一定影响。如果第一池的容积过小，粪便贮留的时间短，达不到粪便分解和沉淀的目的，粪便和虫卵可能进入第二池，不仪增加了第二池的负担，而且容易造成过粪管堵塞。如果第二池容积相对较小，粪便在第二池停留的时间短，则粪便无害化处理效果就差。三个池的比例一般应为2：1：3，第一池贮存20天，第二池贮存10天，第三池贮存30天。化粪池有效深度为1000mm，最多不少于900mm，加上化粪池的上部空间，池深约为1150mm。
化粪池应及时清掏，当沼气积累到达一定高浓度后，遇到静电（是一种处于静止状态的电荷）火星发生燃爆。化粪池是处理粪便并加以过滤沉淀的设备。其原理是固化物在池底分解，上层的水化物体，进入管道流走，防止了管道堵塞，给固化物体（粪便等垃圾）有充足的时间水解。
化粪池对人类粪便进行分解的地方，固化物如果没有及时的分解的话就会堆积起来，久而久之造成化粪池的堵塞，我们知道粪便在分解的过程中会产生大量的沼气和其他有毒其他，所以进行化粪池清理的时候一定要做好防护措施，经常看到的化粪池清理事故就是因为没有做好安全防护措施做成的。