工程结算审计是对施工单位在工程竣工或年度终了时，与建设单位所办理的工程价款结算的审计。其主要内容：(1)中间结算(含跨年)检查工程形象进度的工程量，施工产值和预算成本是否正确、真实、本期应结工程价款净值是否与本期实际完成的施工产值或结算价值，扣除预收工程款、抵扣备料款、甲方材料款以及其他应扣款后的余额相符；(2)竣工结算，应审查竣工质量验收、竣工决算的合规性，未完部分尾工预提费用的合理性以及双方经济往来是否清楚，有无违反结算纪律行为。